V máji a júni sa v Biomedicínskom centre SAV, v. v. i. (BMC SAV) uskutočnili dve päťdňové intenzívne dátové školenia pod vedením organizácie CodeBridge College. Boli otvorené pre všetkých pracovníkov a všetky pracovníčky BMC SAV, čo pracujú s dátami a používajú bioštatistické a bioinformatické metódy, vrátane tých na doktorandskom štúdiu. Zúčastnilo sa ich viac než štyridsať.
Školenia kombinovali teóriu s praktickými zručnosťami a poskytli účastníčkam a účastníkom základy práce s dátami v jazyku Python, porozumenie štatistickým a bioštatistickým metódam, praktické zručnosti v analýze biomedicínskych a omických dát, schopnosť aplikovať moderné prístupy strojového učenia a bioinformatiky, ako aj praktickú skúsenosť s riešením výskumných problémov na reálnych dátach.
Lektorka Laura Johanesová z CodeBridge College hovorí, že školenia boli veľmi intenzívne a praktické: „Oceňujeme kritické zamýšľanie sa nad preberanými témami a diskusie, ktorých bolo viac než na bežných školeniach. Z nášho pohľadu účastníci a účastníčky načerpali zo školení veľmi veľa, najmä preto, že do toho išli aktívne a s chuťou riešiť konkrétne veci zo svojej výskumnej praxe.“
Účastníčka Veronika Liptáková z výskumnej skupiny BMC SAV Traumatické poranenie miechy v Košiciach ocenila najmä priateľský prístup lektorov a veľký priestor na otázky a diskusiu.
„Naučila som sa pracovať s veľkým setom dát, ako ich filtrovať a vyhodnocovať pomocou širokej škály štatistických metód, ktoré sa využívajú v biomedicínskom výskume. Na začiatku týždňa sme sa učili základné príkazy v Pythone a v piatok sme už smelo programovali a analyzovali robustné dáta,“ hovorí Veronika Liptáková.
Najviac sa jej páčil Hackathon, ktorý sa uskutočnil v posledný deň. „Tam sme mali možnosť si otestovať nadobudnuté vedomosti. Odišla som s veľkou dávkou inšpirácie a už teraz sa teším na prípadné ďalšie kurzy, ktoré všetkým odporúčam,“ dodáva.
Účastníčka Pavlína Bartíková z výskumnej skupiny BMC SAV Imunológia vírusov na kurz prišla ako úplná začiatočníčka, a tak pre ňu nebolo ľahké stíhať jeho tempo. „Oba kurzy boli veľmi dobré, ale pre mňa boli veľmi rýchle a aj náročné na vnímanie každý deň od rána do večera. Máme však stále prístup k dátam, inštruktážnym videám, aj k postupom, takže sa viem k tomu spätne vrátiť a dopracovať sa k výsledkom svojím tempom. Vďaka tejto škole a hlavne výborným lektorom, poznám cestu, spôsoby a možnosti, ako sa pýtať, hľadať a spracovávať,“ hovorí.
Text a foto: E. Rybárová, BMC SAV