PhD. program

Biomedicínske centrum SAV, v. v. i. spolupracuje najmä s fakultami slovenských univerzít v oblasti doktorandského štúdia, pričom je akreditovanou externou vzdelávacou inštitúciou pre nasledujúce študijné programy doktorandského štúdia:

UNIVERZITAODBOR
Lekárska fakulta
Univerzity Komenského v Bratislave
normálna a patologická fyziológia
onkológia
Prírodovedecká fakulta
Univerzity Komenského v Bratislave
molekulárna biológia
genetika
mikrobiológia a virológia
fyziológia živočíchov
Fakulta chemickej a potravinárskej technológie
Slovenskej technickej univerzity v Bratislave
biochémia
Prírodovedecká fakulta
Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach
zoológia a fyziológia živočíchov

Témy doktorandského štúdia v BMC SAV, v. v. i. vypísané pre akademický rok 2026/2027

Prírodovedecká fakulta Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach

Termín na podávanie prihlášok: 31. 5. 2026
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty TU.

Študijný program:zoológia a fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Aktivácia endogénnych mechanizmov vedúcich k neuroprotekcii po cievnej mozgovej príhode
Školiteľka:RNDr. Petra Bonová, PhD.
Email:bonova@saske.sk
Kľúčové slová:mozgová ischémia, ischemická tolerancia, kondicionovanie
Anotácia:Náhle cievne mozgové príhody predstavujú v súčasnosti vážny sociálno-ekonomický problém s limitovanými možnosťami liečby. Posledné desaťročia sa v experimentálnej praxi stáva atraktívnym riešením prevencie a liečby takýchto stavov fenomén ischemickej tolerancie, teda aktivácia endogénnych mechanizmov vedúcich k protekcii nedokrvených neurónov. Ciele práce: 1. Štúdium mechanizmov ischemickej tolerancie 2. Definovanie úlohy periférnych krvných buniek v navodení ischemickej tolerancie 3. Testovanie spôsobov in vivo a ex vivo kondicionovania 4. Využitie modelov kondicionovania v animálnych modeloch ischemicko-reperfúzneho poškodenia nervového tkaniva
Študijný program:zoológia a fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Regulácia neurogenézy v mozgu dospelých jedincov
Školiteľka:RNDr. Marcela Martončíková, PhD.
Email:martoncikova@saske.sk
Kľúčové slová:adultná neurogenéza, rostrálna migračná dráha, migrácia neuroblastov
Anotácia:Najväčšou neurogénnou oblasťou v dospelom mozgu je subventrikulárna zóna (SVZ) bočných mozgových komôr. Jej špecifikom je, že bunky vznikajúce v SVZ putujú na dlhé vzdialenosti tzv. rostrálnou migračnou dráhou do bulbus olfactorius, kde sa začleňujú do už existujúcich neurónových okruhov. Poznanie regulačných mechanizmov adultnej neurogenézy je nevyhnutné pre jej prípadné terapeutické využitie. Cieľom dizertačnej práce bude skúmať mechanizmy regulujúce migráciu buniek v rostrálnej migračnej dráhe potkana na základe histologických metód a tiež pomocou in vitro metód.

Lekárska fakulta Univerzity Komenského v Bratislave

Termín na podávanie prihlášok: 30. 5. 2026
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.

Študijný program:onkológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Úloha mitochondrií v odpovedi nádorových buniek na liečbu
Školiteľka:RNDr. Dana Jurkovičová, DrSc.
Email:dana.jurkovicova@savba.sk
Kľúčové slová:nádory testikulárnych zárodočných buniek, terapeutická rezistencia, mitochondrie, metabolizmus, transkriptóm, dynamika vývoja rezistencie
Anotácia:Pri terapeutickej rezistencii testikulárnych karcinómov (TGCT) nespochybniteľnú úlohu zohrávajú aj mitochondrie a metabolické preprogramovanie nádorových buniek. V dizertačnej práci sa zameriame na charakterizáciu metabolických zmien, asociované zmeny génovej exresie a dynamiku týchto zmien na časovej osi. Cieľ 1: Vytvoriť rezistentné bunkové línie a sféroidy TGCT so zvyšujúcou sa toleranciou voči CDDP, v rôznych časových bodoch vývoja rezistencie, charakterizovať ich mitochondrie a metabolické vlastnosti Cieľ 2: Charakterizovať transkripčné a mutačné profily rezistentných bunkových línií TGCT a dynamiku ich zmien počas vývoja rezistencie Cieľ 3: Vyhodnotiť úlohu mitochondrií a metabolickej plasticity v odpovedi TGCT na liečbu Cieľ 4: Overiť dynamiku a časovú os vývoja rezistencie voči CDDP na vzorkách recidivujúcich TGCT pacientov so získanou rezistenciou.
Študijný program:onkológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Identifikácia nových biomarkerov odpovede organizmu na ionizujúce žiarenie
Školiteľ:Mgr. Pavol Košík, PhD.
Email:pavol.kosik@savba.sk
Kľúčové slová:rakovina prsníka, nádory mozgu, leukémia, génová expresia, RNA sekvenovanie, biomarkery, mikroRNA
Anotácia:Rádioterapia, je spolu s chemoterapiou najčastejšou formou terapie používanej na liečbu nádorových ochorení. U 1-5 % pacientov sa však stále vyskytuje vážna akútna toxicita zdravých tkanív asociovaná s rádioterapiou. Doteraz nie sú dostupné žiadne biomarkery, pomocou ktorých by sme boli schopný detegovať týchto pacientov pred začatím rádioterapie. Cieľom tejto práce je preskúmať potenciálne nové markery použiteľné na detekciu rádiosenzitívnych pacientov založené na analýze expresie génov, ktoré citlivo odpovedajú na ožiarenie ionizujúcim žiarením a ich validovanie v podmienkach in vitro aj in vivo (u pacientov podstupujúcich rádioterapiu).
Študijný program:onkológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Analýza vplyvu zmien črevného mikrobiómu u onkologických pacientov
Školiteľka:doc. RNDr. Soňa Čierniková, PhD., MPH
Email:sona.ciernikova@savba.sk
Kľúčové slová:črevný mikrobióm, mikrobiálna diverzita, onkologickí pacienti, protinádorová liečba
Anotácia:V súčasnosti sa výskum v oblasti črevného mikrobiómu v onkológii zameriava na dôležitú úlohu mikroorganizmov v etiológii a tiež v progresii rôznych druhov onkologických ochorení. Zmeny v zložení črevného mikrobiómu môžu ovplyvniť imunitnú odpoveď organizmu na nádorové bunky, čo môže podporiť alebo spomaliť vývoj nádorov. Črevný a nádorový mikrobióm zohráva úlohu v odpovedi na protinádorovú terapiu a toxicitu liečby. Cieľom dizertačnej práce bude analýza zmien črevného mikrobiómu u onkologických pacientov a ich vplyvu na klinicko-patologické parametre pacientov.
Študijný program:onkológia
Forma štúdia:externá
Názov práce:Štúdium črevného mikrobiómu u pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek
Školiteľka:doc. RNDr. Soňa Čierniková, PhD., MPH
Email:sona.ciernikova@savba.sk
Kľúčové slová:mikrobióm, mikrobiálna diverzita, testikulárny karcinóm z germinatívnych buniek, protinádorová liečba
Anotácia:Štúdium mikrobiómu sa v súčasnosti dostáva do popredia onkologického výskumu. U pacientov s rôznymi typmi nádorových ochorení bolo pozorované zmenené zloženie črevnej mikrobioty. Navyše, pribúdajú experimentálne aj klinické štúdie, ktoré poukazujú na dôležitú úlohu mikrobiómu nielen v tumorigenéze, ale tiež v účinnosti protinádorovej terapie. Cieľom dizertačnej práce bude štúdium črevného mikrobiómu u pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek.
Študijný program:normálna a patologická fyziológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Úloha komponentov alternatívnych dráh renín-angiotenzínového systému pri kardiovaskulárnych komplikáciach obezity a diabetu 2. typu
Školiteľka:Ing. Katarína Kršková, PhD.
Email:katarina.krskova@savba.sk
Kľúčové slová:renín-angiotenzínový systém, angiotenzín-konvertujúci enzým 2, ACE2, obezita, diabetes mellitus 2. typu
Anotácia:V súčasnosti sa veľká pozornosť vo výskume nádorových ochorení sústreďuje na objavenie Obezita a prozápalové aktivity tukového tkaniva predstavujú kľúčový rizikový faktor pre vznik a rozvoj kardiovaskulárnych ochorení. Produkcia komponentov klasického renín-angiotenzínového systému (RAS) je v obezite nadmerne aktivovaná a zvýšená tvorba angiotenzínu II prispieva k progresii metabolických porúch. Súčasný pohľad na RAS sa však stáva oveľa komplexnejším vďaka objaveniu tzv. protektívnych alternatívnych dráh zahrňujúcich angiotenzín-konvertujúci enzým 2 (ACE2) a angiotenzín-(1-7). Práca bude zameraná na štúdium alternatívnych dráh RAS u samíc obéznych potkanov s diabetes mellitus II. typu (ZDF) po chirurgickej ovariektómii, ako aj na identifikáciu vplyvu týchto dráh na mechanizmy kardiovaskulárnych porúch s cieľom lepšie špecifikovať terapie pre obézne diabetické pacientky so závažnou dyslipidémiou alebo ženy po menopauze.

Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského v Bratislave

Termín na podávanie prihlášok: 31. 5. 2026
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.
Viac informácií k prihláške nájdete tu.

Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Mitochondriálna redoxná signalizácia v metabolických ochoreniach
Školiteľka:Mgr. Lenka Tomášová, PhD.
Email:lenka.tomasova@savba.sk
Kľúčové slová:kardiometabolické ochorenia, oxidačný stres, mitochondria, feroptóza, lipidová peroxidacia
Anotácia:Metabolický syndróm (MetSyn) je multifaktoriálne ochorenie spôsobené súborom rizikových faktorov, medzi ktoré patria abdominálna obezita, hypertenzia, dyslipidémia a inzulínová rezistencia. Oxidačný stres je kľúčovým patologickým znakom MetSyn a prispieva k aktivácii ferroptózy, regulovanej formy bunkovej smrti sprostredkovanej akumuláciou lipidových peroxidov v bunkových membránach. Mitochondrie zohrávajú zásadnú úlohu v regulácii redoxnej rovnováhy a bunkovej bioenergetiky. Cieľom dizertačnej práce je skúmať, ako metabolický stres ovplyvňuje redoxnú signalizáciu a mitochondriálne funkcie v experimentálnych modeloch ochorení.
Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Nový prístup v terapii post-traumatickej stresovej poruchy (PTSD): kombinované podávanie antipsychotík a probiotík
Školiteľka:RNDr. Jana Osacká, PhD.
Email:jana.bundzikova@savba.sk
Kľúčové slová:PTSD, antipsychotiká, neuroplasticita, mikrobióm
Anotácia:Post-traumatická stresová porucha (PTSD) je závažné psychiatriacké ochorenie, ktoré ovplyvňuje rôzne biologické procesy, vrátane zmien v neurogenéze a neuroplasticite. Atypické antipsychotiká, farmaká používané pri liečbe PTSD, majú okrem potlačenia negatívnych prejavov PTSD aj nežiaduce vedľajšie účinky, vrátane ovplyvnenia črevnej mikroflóry. V poslednej dobe sa zdôrazňuje úloha črevnej mikroflóry pri psychiatrických ochoreniach, aj pri PTSD. Avšak, vzájomné prepojenia medzi liečbou antipsychotikami, črevnou mikroflórou a mozgom pri PTSD nie sú úplne objasnené. Preto cieľom dizertačnej práce bude sledovať: 1. Účinnosť kombinovanej liečby antipsychotikum-probiotiká na zmeny správania a neuroplasticity na animálnom modeli PTSD. 2. Účinnosť kombinovanej liečby antipsychotikum-probiotiká na zmeny správania a neuroplasticity po opätovnom vystavení PTSD zvierat stresovému podnetu. 3. Účinky kombinovanej liečby antipsychotikum-probiotická liečba na profil črevnej mikroflóry a translokáciu črevných baktérií u zvierat s PTSD.
Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Úloha komponentov alternatívnych dráh renín-angiotenzínového systému pri kardiovaskulárnych komplikáciach obezity a diabetu 2. typu
Školiteľka:Ing. Katarína Kršková, PhD.
Email:katarina.krskova@savba.sk
Kľúčové slová:renín-angiotenzínový systém, angiotenzín-konvertujúci enzým 2, ACE2, obezita, diabetes mellitus 2. typu
Anotácia:Obezita a prozápalové aktivity tukového tkaniva predstavujú kľúčový rizikový faktor pre vznik a rozvoj kardiovaskulárnych ochorení. Produkcia komponentov klasického renín-angiotenzínového systému (RAS) je v obezite nadmerne aktivovaná a zvýšená tvorba angiotenzínu II prispieva k progresii metabolických porúch. Súčasný pohľad na RAS sa však stáva oveľa komplexnejším vďaka objaveniu tzv. protektívnych alternatívnych dráh zahrňujúcich angiotenzín-konvertujúci enzým 2 (ACE2) a angiotenzín-(1-7). Práca bude zameraná na štúdium alternatívnych dráh RAS u samíc obéznych potkanov s diabetes mellitus II. typu (ZDF) po chirurgickej ovariektómii, ako aj na identifikáciu vplyvu týchto dráh na mechanizmy kardiovaskulárnych porúch s cieľom lepšie špecifikovať terapie pre obézne diabetické pacientky so závažnou dyslipidémiou alebo ženy po menopauze.
Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Štúdium molekulárnych mechanizmov regulácie metabolickej aktivity tukového tkaniva
Školiteľ:Mgr. Miroslav Baláž, PhD.
Email:miroslav.balaz@savba.sk
Kľúčové slová:tukové tkanivo, adipocyty, metabolizmus, termogenéza, „omics“ analýzy
Anotácia:Metabolická aktivácia tukového tkaniva je považovaná za veľmi sľubnú stratégiu prevencie a liečby obezity a pridružených metabolických ochorení. Cieľom projektu je identifikovať nové molekuly a signálne dráhy s potenciálom riadiť formovanie a aktivitu hnedých a béžových tukových buniek. Experimentálna práca na tukových bunkách, genetických myších modeloch a vzorkách ľudského tukového tkaniva s využitím bežných molekulárno-biologických metód a najnovších prístupov bude prebiehať v Biomedicínskom centre SAV, s možnosťou absolvovať krátkodobý študijný pobyt v zahraničí.
Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Neuroendokrinné dysregulácie v kontexte stresu a psychických porúch
Školiteľka:RNDr. Nataša Hlaváčová, PhD.
Email:natasa.hlavacova@savba.sk
Kľúčové slová:psychické poruchy, neuroendokrinný systém, stres, neurotransmitery
Anotácia:V súčasných moderných civilizáciach je stres Práca bude zameraná na štúdium neurobiologických a neuroendokrinných mechanizmov podieľajúcich sa na regulácii kognitívnych a behaviorálnych funkcií mozgu a ich úlohy v pri vzniku psychických porúch, najmä depresie. Výskum sa bude sústreďovať na interakcie monoamínových neurotransmiterových systémov s hormonálnymi a neuropeptidovými signálnymi dráhami. Osobitná pozornosť bude venovaná atypickým účinkom periférnych a centrálnych hormónov na psychické funkcie. Práca bude realizovaná v animálnych modeloch ako aj humánnych štúdiách s využitím interdisciplinárnych metodických prístupov.
Študijný program:fyziológia živočíchov
Forma štúdia:denná
Názov práce:Zmeny inhibičnej neurotransmisie pri neurovývinových ochoreniach
Školiteľ:doc. RNDr. Ján Bakoš, PhD.
Email:j.bakos@savba.sk
Kľúčové slová:mozog, GABA, vývin, autizmus
Anotácia:Kyselina gama-aminomaslová (GABA) je jedným z najdôležitejších inhibičných neurotransmiterov v centrálnom nervovom systéme, pričom sa predpokladá, že tvorba neurónov produkujúcich GABA, diferenciácia ich podtypov ako aj pôsobenie GABA na postsynaptickej membráne sú dôležitými činiteľmi vo vývine mozgu. Cieľom práce bude hodnotiť markery a zmeny inhibičnej neurotransmisie v oblastiach mozgu relevantných pre rozvoj sociálneho správania. Plánuje sa použitie transgénneho myšieho model autizmu, imunohistologické hodnotenie postsynaptických proteínov a analýza správania pre komplexné pochopenie mechanizmov vedúcich k neurovývinovým ochoreniam.
Študijný program:genetika
Forma štúdia:denná
Názov práce:Úloha mitochondrií v odpovedi nádorových buniek na liečbu
Školiteľka:RNDr. Dana Jurkovičová, DrSc.
Email:dana.jurkovicova@savba.sk
Kľúčové slová:nádory testikulárnych zárodočných buniek, terapeutická rezistencia, mitochondrie, metabolizmus, transkriptóm, dynamika vývoja rezistencie
Anotácia:Rýchly rozvoj nanotechnológií vedie k produkcii inovatívnych (nano)produktov a aplikácií, zároveň však vyvoláva obavy z možného vystavenia ľudí
Pri terapeutickej rezistencii testikulárnych karcinómov (TGCT) nespochybniteľnú úlohu zohrávajú aj mitochondrie a metabolické preprogramovanie nádorových buniek. V dizertačnej práci sa zameriame na charakterizáciu metabolických zmien, asociované zmeny génovej exresie a dynamiku týchto zmien na časovej osi.
Cieľ 1: Vytvoriť rezistentné bunkové línie a sféroidy TGCT so zvyšujúcou sa toleranciou voči CDDP, v rôznych časových bodoch vývoja rezistencie, charakterizovať ich mitochondrie a metabolické vlastnosti
Cieľ 2: Charakterizovať transkripčné a mutačné profily rezistentných bunkových línií TGCT a dynamiku ich zmien počas vývoja rezistencie
Cieľ 3: Vyhodnotiť úlohu mitochondrií a metabolickej plasticity v odpovedi TGCT na liečbu
Cieľ 4: Overiť dynamiku a časovú os vývoja rezistencie voči CDDP na vzorkách recidivujúcich TGCT pacientov so získanou rezistenciou.
Študijný program:genetika
Forma štúdia:denná
Názov práce:Aplikácia prírodných rastlinných extraktov a olejov v oblasti potravinových obalových materiálov
Školiteľka:RNDr. Katarína Kozics, PhD.
Email:katarina.kozics@savba.sk
Kľúčové slová:cyto/genotoxicita, antioxidačná aktivita, ROS, prírodné látky, polymér PLA/PHB
Anotácia:Cieľom práce je vylepšiť biotechnologické parametre obalových materiálov (biodegradovateľné polyméry PLA/PHB obohatené o rastlinné oleje a extrakty) pre ovocie a zeleninu. Biologická aktivita obalov bude sledovaná in vitro na rôznych bunkových líniách s využitím širokej škály biochemických, biologických a molekulárno-genetických prístupov. Očakáva sa predĺženie trvanlivosti a zvýšenie bezpečnosti potravín.
Študijný program:genetika
Forma štúdia:denná
Názov práce:Identifikácia génov regulujúcich apokrinnú sekréciu
Školiteľ:RNDr. Robert Farkaš, CSc.
Email:robert.farkas@savba.sk
Kľúčové slová:apokrinná sekrécia, intracelulárny transport, mechanizmus externalizácie, genetický skríning, fenotypová analýza, génové interakcie
Anotácia:Apokrinná sekrécia je novo objavený a definovaný od Golgiho aparátu nezávislý nevezikulárny transportný a sekretorický mechanizmus vyskytujúci sa výlučne u metazoálnych eukaryontov, a preto nesie evolučne dôležité signatúrne znaky charakterizujúce túto veľkú systematickú skupinu. Z praktického hľadiska, poruchy apokrinnej sekrécie resp. apokrinných žliaz sú spojené s radom chronických diagnóz a nádorových ochorení. Cieľom nášho výskumu je identifikovať tieto molekulárne determinanty a odhaliť komponenty apokrinnej signálnej dráhy.
Študijný program:genetika
Forma štúdia:denná
Názov práce:Štúdium biologických funkcií málo charakterizovaných faktorov zostrihu pre-mRNA
Školiteľ:Ing. Ľuboš Čipák, PhD.
Email:lubos.cipak@savba.sk
Kľúčové slová:zostrih pre-mRNA; regulácia expresie génov; stabilita genómu; afinitná izolácia; S. pombe
Anotácia:Cieľom dizertačnej práce bude objasniť biologické funkcie doteraz málo charakterizovaných faktorov zostrihu pre-mRNA kvasinky Schizosaccharomyces pombe.
Študijný program:genetika
Forma štúdia:externá
Názov práce:Genetická epidemiológia ako nástroj na predikciu rizika multifaktoriálnych ochorení
Školiteľ:Mgr. Božena Smolková, PhD.
Email:bozena.smolkova@savba.sk
Kľúčové slová:genetická epidemiológia, biomarkery, metylácia DNA, poškodenie DNA
Anotácia:Cieľom práce bude zhodnotiť epidemiologické štúdie zamerané na vzťah medzi genetickými faktormi, environmentálnymi expozíciami a vznikom multifaktoriálnych ochorení. Osobitná pozornosť bude venovaná metylácii DNA ako epigenetickému biomarkeru expozície využiteľnému v geneticko-epidemiologických analýzach.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Molekulárna analýza funkcie génov regulujúcich apokrinnú sekréciu
Školiteľ:RNDr. Robert Farkaš, CSc.
Email:robert.farkas@savba.sk
Kľúčové slová:apokrinná sekrécia, intracelulárny transport, mechanizmus externalizácie, generovanie transgénnych konštruktov a ich fenotypová analýza, proteín-proteínové interakcie, proteomika
Anotácia:Apokrinná sekrécia (AS) patrí medzi málo charakterizované tzv. nekanonické typy sekrécie a na rozdiel od známej a dobre preštudovanej exocytózy zatiaľ nepoznáme žiadne proteíny resp. gény, ktoré regulujú tento proces. AS je od Golgiho aparátu nezávislý nevezikulárny transportný a sekretorický mechanizmus vyskytujúci sa výlučne u metazoálnych eukaryontov, a preto nesie evolučne dôležité signatúrne znaky charakterizujúce túto veľkú systematickú skupinu. Z praktického hľadiska, poruchy apokrinnej sekrécie resp. apokrinných žliaz sú spojené s radom chronických diagnóz a nádorových ochorení. Cieľom nášho výskumu je identifikovať tieto molekulárne determinanty určujúce priebeh apokrinného vylučovacieho procesu, odhaliť a molekulárne charakterizovať kľúčové komponenty apokrinnej signálnej dráhy.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Epigenetické mechanizmy v procese metastázovania
Školiteľka:doc. Mgr. Andrea Šoltýsová, PhD.
Email:andrea.soltysova@savba.sk
Kľúčové slová:epigenetika, metastázy, metylácia, liečba
Anotácia:Najnovšie poznatky ukazujú, že epigenetika hrá dôležitú úlohu vo vývoji nádorového ochorenia ako aj v jeho progresii a pri tvorbe metastáz. V rámci práce budú identifikované a následne študované kandidátne gény, ktoré by mohli zohrávať kľúčovú úlohu vo vzniku alebo šírení metastáz. Pochopenie mechanizmov v metastatických bunkách by mohlo viesť k výberu vhodnej terapii.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Inovatívne stratégie genómovej a epigenetickej editácie pre cielenú terapiu
Školiteľka:doc. Mgr. Andrea Šoltýsová, PhD.
Email:andrea.soltysova@savba.sk
Kľúčové slová:epigenetika, terapia, prime editovanie, epigenomické editovanie
Anotácia:Genetické a epigenetické zmeny zohrávajú kľúčovú úlohu pri vzniku a progresii ochorení. Identifikácia týchto biomarkerov je kľúčová a spolu s možnosťami editácie genómu predstavujú nové terapeutické možnosti. Cieľom je vyvinúť a optimalizovať systémy pre editovanie cez RNA a epigenomicke editovanie s cieľom maximalizovať presnosť, účinnosť a bezpečnosť v terapii vybraných ochorení.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Skúmanie biomedicínsky významných fenoménov vo vírusovej imunológií
Školiteľka:Mgr. Ivana Nemčovičová, PhD.
Email:ivana.nemcovicova@savba.sk
Kľúčové slová:vírus, glykoproteín, bunkový receptor, proteínové interakcie, immunomodulácia, rekombinantný expresný systém, genetická manipulácia, kryštalizácia, štruktúrna analýza
Anotácia:Hlavným cieľom práce je podrobne skúmať molekulárne základy imunitného rozpoznávania klinicky významných glykoproteínov kódovaných ľudskými vírusmi. Za týmto účelom plánujeme rekombinantne pripraviť, charakterizovať a stanoviť expresné a purifikačné profily vírusových i ľudských génov, ktoré sú asociované s procesmi cytotoxicity a viroprotektivity v bunke.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Mikroevolučné procesy v nádorovej progresii: úloha karbonickej anhydrázy IX vo fenoméne „bunka v bunke“
Školiteľka:prof. RNDr. Silvia Pastoreková, DrSc.
Email:silvia.pastorekova@savba.sk
Kľúčové slová:bunka v bunke, nádorové mikroprostredie, adaptácia, hypoxia, acidóza, karbonická anhydráza IX
Anotácia:Štruktúry „bunka v bunke“ boli v nádorových tkanivách pozorované po desaťročia, napriek tomu zostávajú mechanizmy ich vzniku a aj význam pre nádorovú progresiu nevyjasnené. Predpokladá sa, že sa podieľajú na mikroevolučných procesoch odohrávajúcich sa v heterogénnom nádorovom tkanive a vedú k selekcii agresívnych nádorových buniek. Cieľom práce bude objasniť príspevok hypoxie a acidózy v nádorovom mikroprostredí k tvorbe štruktúr „bunka v bunke“. Zameriame sa na karbonickú anhydrázu IX, ktorá zohráva kľúčovú úlohu v pH regulácii ako adaptívnej odpovede nádorových buniek na hypoxiu a onkogénny metabolizmus. Na dosiahnutie tohto cieľa použijeme najaktuálnejšie prístupy molekulárnej a bunkovej biológie ako aj experimentálnej onkológie.
Študijný program:molekulárna biológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Detekcia nových mutácií u pacientov s hematologickými nádormi
Školiteľka:RNDr. Katarína Lopušná, PhD.
Email:katarina.lopusna@savba.sk
Kľúčové slová:hematologické nádory, mutácie, NGS, Sangerovo sekvenovanie
Anotácia:Liečba agresívnych hematologických malignít predstavuje významnú klinickú výzvu a jej účinnosť zostáva obmedzená. Identifikácia nových biomarkerov založených na sekvenovaní genomickej DNA a RNA je preto nevyhnutná na zlepšenie diagnostických postupov a terapeutických stratégií. Cieľom predkladaného projektu je: 1. analýza NGS dát dostupných vo verejných databázach s využitím základných bioinformatických nástrojov, 2. identifikácia genetických mutácií u pacientov s hematologickými nádormi z krvných vzoriek, 3. experimentálne potvrdenie novo identifikovaných mutácií pomocou Sangerovho sekvenovania.
Študijný program:mikrobiológia a virológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Pôvodcovia rickettsióz a iných kliešťami prenášaných ochorení: perspektívy neantibiotickej terapie
Školiteľka:Mgr. Eva Špitalská, DrSc.
Email:eva.spitalska@savba.sk
Kľúčové slová:kliešťami prenášaný patogén, kliešť, človek, variabilita, ochorenie, nanomateriál
Anotácia:Rickettsiózy patria medzi najstaršie známe ochorenia prenášané vektormi. Lymská borelióza je najčastejšou infekciou prenášanou kliešťami. Geografická distribúcia rickettsií súvisí s ich vektormi. Stále sa identifikujú nové prípady rickettsióz a nové lokality, kde je prítomnosť týchto baktérií rozpoznaná. Antibiotická rezistencia je celosvetový problém a možno jedného dňa liečba chorôb prenášaných kliešťami nebude účinná. Cieľom štúdie je poznať pôvodcov kliešťami prenášaných ochorení, ich variabilitu, diagnostika týchto ochorení a ich liečba vo včasnom štádiu akútnej infekcie použitím nových nanomateriálov.
Študijný program:mikrobiológia a virológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Príčiny klinickej variability ochorenia kliešťová encefalitída
Školiteľka:RNDr. Martina Ličková, PhD.
Email:martina.lickova@savba.sk
Kľúčové slová:kliešťová encefalitída, flavivírusy, interferón typu I, auto-protilátky
Anotácia:Kliešťová encefalitída (TBE) je neuroinfekčné ochorenie spôsobené vírusom kliešťovej encefalitídy (TBEV). TBE má veľmi rôznorodý klinický priebeh pričom faktory, ktoré sú zodpovedné za ťažké formy ochorenia, nie sú dostatočne známe. Cieľom dizertačnej práce je zistiť aké faktory na úrovni hostiteľa (prítomnosť autoprotilátok proti IFN I) alebo vírusu (skrížené reakcie s inými flavivírusmi, genetická variabilita TBEV) určujú mieru závažnosti TBE. Na dosiahnutie cieľov použijeme imunologické, virologické a molekulárno-biologické (NGS) metódy.
Študijný program:mikrobiológia a virológia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Subtypizácia a detekcia mutácií herpetických vírusov prostredníctvom PCR a sekvenovania
Školiteľka:RNDr. Katarína Lopušná, PhD.
Email:katarina.lopusna@savba.sk
Kľúčové slová:herpesvírusy, mutácie, NGS, Sangerovo sekvenovanie
Anotácia:Pacienti s nádormi trpia imunodeficienciami, ktoré narúšajú funkciu jednej alebo viacerých zložiek imunitného systému. Veľké riziko v tomto ohľade predstavujú predovšetkým vírusové infekcie. Predložená téma sa zameriava na diferenciálnu diagnostiku nešpecificky identifikovateľných herpesvírusov vo vzorkách pacientov, ako aj na identifikáciu mutácií asociovaných s rezistenciou na antivirotiká. Cieľom predkladaného projektu je: 1. detekcia HCMV, HHV-6 a EBV z krvných vzoriek a nechtov pacientov prostredníctvom PCR a kvantitatívnej PCR (qPCR) 2. identifikácia mutácií HCMV, HHV-6 a EBV, ktoré by mohli súvisieť s rezistenciou 3. experimentálne potvrdenie novo identifikovaných mutácií pomocou Sangerovho sekvenovania.
Študijný program:mikrobiológia a virológia
Forma štúdia:externá
Názov práce:Patogénmi vyvolaná lipidomická a metabolická adaptácia článkonožcov
Školiteľ:Ing. Ľudovít Škultéty, DrSc.
Email:ludovit.skultety@savba.sk
Kľúčové slová:článkonožce, patogény prenášané kliešťami, lipidomika, metabolomika, interakcia hostiteľ-patogén
Anotácia:Bezstavovce vykazujú komplexné metabolické reakcie na kolonizáciu mikroorganizmami, ktoré zásadne ovplyvňujú ich kondíciu. Metabolizmus lipidov zohráva kľúčovú úlohu v energetickej homeostáze, dynamike membrán a imunitnom signalizovaní Táto dizertačná práca si kladie za cieľ preskúmať remodeláciu lipidového a metabolického profilu indukovanú infekciou u vybraných hostiteľov z radu bezstavovcov, so zameraním na kliešte (Ixodes ricinus a Dermacentor reticulatus) a husenice Galleria mellonella. Stav infekcie bude hodnotený prostredníctvom PCR diagnostiky. Na identifikáciu systémových a tkanivovo špecifických metabolických zmien spojených s infekciou budú využité komplexné proteomické a metabolomické analýzy, vrátane profilovania lipidov pomocou plynovej chromatografie–hmotnostnej spektrometrie (GC-MS) a priestorovo rozlíšenej zobrazovacej hmotnostnej spektrometrie (MSI).

Fakulta chemickej a potravinárskej technológie Slovenskej technickej univerzity v Bratislave

Termín na podávanie prihlášok: 31. 5. 2026
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.

Študijný program:biochémia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Mitochondriálna redoxná signalizácia v metabolických ochoreniach
Školiteľka:Mgr. Lenka Tomášová, PhD.
Email:lenka.tomasova@savba.sk
Kľúčové slová:kardiometabolické ochorenia, oxidačný stres, mitochondria, feroptóza, lipidová peroxidacia
Anotácia:Metabolický syndróm (MetSyn) je multifaktoriálne ochorenie spôsobené súborom rizikových faktorov, medzi ktoré patria abdominálna obezita, hypertenzia, dyslipidémia a inzulínová rezistencia. Oxidačný stres je kľúčovým patologickým znakom MetSyn a prispieva k aktivácii ferroptózy, regulovanej formy bunkovej smrti sprostredkovanej akumuláciou lipidových peroxidov v bunkových membránach. Mitochondrie zohrávajú zásadnú úlohu v regulácii redoxnej rovnováhy a bunkovej bioenergetiky. Cieľom dizertačnej práce je skúmať, ako metabolický stres ovplyvňuje redoxnú signalizáciu a mitochondriálne funkcie v experimentálnych modeloch ochorení.
Študijný program:biochémia
Forma štúdia:denná
Názov práce:Úloha proteínkináz v regulácií procesov zostrihu pre-mRNA
Školiteľ:Ing. Ľuboš Čipák, PhD.
Email:lubos.cipak@savba.sk
Kľúčové slová:zostrih pre-mRNA; proteínkináza; regulácia expresie génov; afinitná izolácia; S. pombe
Anotácia:Regulácia zostrihu pre‑mRNA predstavuje kľúčový krok génovej expresie. Napriek poznaniu základných mechanizmov zostrihu pre-mRNA zostáva úloha mnohých regulačných faktorov, najmä proteínkináz, stále nedostatočne objasnená. Cieľom dizertačnej práce bude objasniť biologické funkcie vybraných proteínkináz na regulácii procesov zostrihu pre‑mRNA v kvasinke S. pombe. Práca sa zameria na identifikáciu substrátov týchto kináz, analýzu ich vplyvu na dynamiku spliceozómu a charakterizáciu fenotypových dôsledkov narušenia ich aktivity.